Les différents parlements des jeunes de Suisse ont des points communs dans leur fonctionnement. Ils sont tous dirigés par un comité ou une présidence.

En plus de l’assemblée plénière où les membres se prononcent sur les objets importants comme les projets, les prises de position politiques, les demandes aux autorités et l'élection du comité, il y a des groupes de travail et des commissions qui s’occupent de la réalisation des projets. Une assemblée plénière peut être convoquée une ou plusieurs fois par année. C’est aux PJs de prendre les décisions et de définir leur organisation. Ils peuvent bénéficier si besoin d’un soutien de la FSPJ.